放开那三国3作为一款策略卡牌手游，武将技能机制是战斗系统的核心要素。游戏中的武将技能分为必杀技和普通技能两类，必杀技需要积攒怒气值释放，普通技能则分为光环型、触发型和主动型三种。怒气值通过普通攻击、受到伤害和释放技能三种方式获取，当怒气达到1000点即可点击释放必杀技，手动释放可精准打断敌方关键技能，自动释放则能实现多武将技能联动。
武将职业定位直接影响技能效果，谋士类武将如诸葛亮、周瑜拥有强力的群体魔法伤害和控制能力，其技能往往附带眩晕、减速等debuff效果。护卫型武将如关羽、许褚则以高防御和生存技能见长，技能常带有护盾、回血等增益机制。先锋类武将如赵云、马超擅长突进和单体爆发，刺客型如吕绮玲则具备后排切入和持续输出特性。不同职业的技能组合需要根据战场需求灵活搭配。
技能等级提升会显著增强效果，例如周泰的怒气技达到3级后可附加50%伤害转化治疗的效果，于禁的神速技能在升级后能同时降低敌人攻击力和命中率。技能研究系统允许玩家拆解特定武将获取稀有技能，如通过分解汉刘备、蜀糜夫人等武将可获得恢复型技能青囊秘要，该技能每回合能恢复150%兵力。
战斗中的技能释放时机直接影响战局走向，面对孙坚、文丑等高回复型敌人时，需优先使用带封疗效果的技能；在敌方聚集时释放关羽的青龙偃月刀等范围技能可最大化伤害。九宫格布阵系统允许通过调整站位引导技能释放方向，例如将控制型武将置于中排可覆盖更多目标，后排则适合安置辅助和治疗型武将。
跨阵营搭配能突破技能组合限制，游戏中的羁绊系统无需上阵同阵营武将即可激活属性加成。玩家可自由组合如貂蝉的群体魅惑、华佗的复活技能与张辽的远程输出，形成独特的技能联动体系。资源继承机制使得玩家能无损更换武将，方便针对不同副本调整技能组合策略。
