主舰作为舰队的核心单位，其移动效率直接影响战斗部署和资源调度，由于主舰通常移动速度较慢，直接调动会拖累整个舰队的行动，因此玩家需要掌握高效的移动策略来优化战场表现，通过合理利用游戏机制，可以避免主舰在转移过程中成为薄弱环节，从而提升整体作战能力。
调动主舰的核心方法是利用增援指令和计划圈功能，玩家可以先用高速护卫舰建立计划圈并飞到目标点，因为计划圈内已有己方舰船时会激活曲率航行支持，这时候再增援主舰，它就能以更快的曲率速度快速抵达目的地，大幅缩短移动时间，这种方法特别适用于移动缓慢的主舰类型，能有效避免因直接航行而导致的延误和风险。
针对移动速度不同的主舰，玩家需要调整组队策略，对于基础移速较慢的主舰，应避免与同样低速的战列巡洋舰混编，以免影响整体机动性；而移速稍快的主舰则可以与巡洋舰组队，在保持一定速度的同时增强战斗力，这种分类处理方式能帮助玩家根据主舰特性灵活部署，确保舰队在转移中保持协调和效率。
如果主舰需要撤退，切勿让它单独缓慢返回基地，而应使用工程舰一同撤回，以防止敌人追踪航线发起攻击，此外平时应预留几艘工程舰专门负责主舰的维修工作，确保在战后能及时修复损伤，维持舰队战斗力，这些措施能减少主舰在移动和战斗中的脆弱性，提升长期生存能力。
由于主舰的建造时间较长，玩家最好在安全的时段安排生产，例如在睡前启动建造队列，以避免在资源紧张或敌方活跃时暴露弱点，合理规划生产时机和资源分配，能有效提升主舰的生存率和作战效率，同时注意在移动前后检查主舰的状态，确保其装备和舰载机完好，以应对可能的突发情况。
